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爱丁堡大学分为人文与社会科学学院、科学与工程科学学院、医学与兽医科学学院三大学院三大学院下属23 个学院分别为:
商学院、爱丁堡艺术学院、莫雷教育学院、神学院、经济学院、社会健康科学学院、历史、古典和考古学院、法学院、文学、语言和文化学院、哲学、
心理学和语言科学学院、社会和政治科学学院、开放学习中心、生物科学学院、化学学院、工程学院、地球科学学院、信息学院、数学学院、
物理和天文学院、爱丁堡医学院、皇家(狄克)兽医研究院、生物医学学院、临床科学和社区卫生学院