马来西亚南方学院共成立八个学部，为学生们提供了25项课程，其中包括了16个文凭课程、4个双联学士课程、3个大学基础课程和2个证书课程。
课程设置
截至2011年6月，南方学院共有25个课程获“国家学术资格鉴定机构”（MQA）颁发开课准证，其中有16个课程获得最高认证。同时，所有报读获得最高认证之课程的学生都有资格申请高教贷款（PTPTN），而最高认证课程毕业生可担任公职或以学分转移方式进入国内国立大学。
马来西亚南方学院有工商管理学位课程和文凭证书课程，学习专业有商业证书、电脑证书课程、会计专业文凭、企业管理专业文凭、国际贸易与电子商务专业文凭、市场行销专业文凭、物流管理专业文凭、金融分析专业文凭、资讯科技专业文凭、电脑科学专业文凭、电机与电子工程专业文凭、英文专业文凭、中文专业文凭、工业设计专业文凭、广告设计专业文凭、时尚（服装)设计专业文凭、新闻与传播专业文凭。
